办理食品QS认证需要遵循以下步骤：
准备申请材料
《食品安全生产许可证申请书》
企业营业执照
食品卫生许可证
企业代码证（复印件）
提交申请
按照地域管辖和分级管理的原则，到所在地的省级或市（地）级质量技术监督管理部门提交办理生产许可证的申请。
材料审查
质量技术监督部门在接到企业申请材料后，在15个工作日内组成审查组，完成对申请书和资料等文件的审查。
企业材料符合要求后，发给《食品生产许可证受理通知书》。如果企业材料不符合要求，需要在20个工作日内补正，逾期未补正的，视为撤回申请。
现场审查
企业书面材料合格后，审查组将在40个工作日内对企业必备条件和出厂检验能力进行现场审查。
审查内容包括环境卫生、生产资源、原辅材料、生产加工、产品、人员、检验、包装与标签标示、储运、质量管理等方面。
样品检验
企业将在10个工作日内（有特殊规定的除外）将样品送达指定的检验机构进行检验。
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